1．(1)招标人不退还投标人甲投标保证金的做法不妥当。
理由：拒绝延长投标有效期的投标人有权收回投标保证金。
(2)投标保证金不予退还的情形有：投标人在规定的投标有效期内撤销或修改其投标文件；中标人在收到中标通知书后，无正当理由拒签合同协议书或未按招标文件规定提交履约担保的。
2．(1)被查实存在影响中标结果的违法行为的情形，不符合中标条件的，招标人可以按照评标委员会提出的中标候选人名单排序依次确定其他中标候选人为中标人，也可以重新招标。 (2)除背景资料所述情形外，第一中标候选人资格被取消的情形还有：排名第一的中标候选人放弃中标；因不可抗力不能履行合同；不按照招标文件要求提交履约保证金。
3．事件三表3中，文件编号2～7分别对应的解释合同的优先次序序号是七、六、二、五、三、四。
4．(1)农民工工资专用账户，专项用于支付该工程建设项目农民工工资。
(2)申请注销农民工工资专用账户的条件：工程完工且未拖欠农民工工资的，施工总承包单位公示30日后，可以申请注销农民工工资专用账户。
(3)申请注销后账户内余额归施工总承包单位所有。
